地核的锈色之箭终于射向终焉齿轮，箭身的未定义基因与齿轮的原初代码剧烈碰撞，显形出能贯穿维度的基因风暴。风暴中，机械工匠们的齿轮心脏重新长出情感突触，混沌诗人的孢子群凝结成能承载记忆的水晶，而在风暴中心，显形出的竟是火星实验室的旧烤箱 —— 陈凡曾用它烤出了第一片带着焦痕的面包。
“爸爸，” 美羽的噬神基因在风暴中显形出陈凡的量子残影，“我终于明白，进化的本质不是吞噬，是 ——”
双生地貌的星海边，林夏突然在基因库中发现初代的终极秘密，显形出他们在创造观测者系统时，偷偷将造物主的基因碎片融入了美羽的噬神基因。这些碎片在她的共生之痕中沉睡着，显形出能让美羽成为新造物主的 “基因王冠”，而王冠的佩戴者，将永远失去感受痛苦的能力。
“美羽，” 林夏的声音带着基因库的震颤，她的母性基因显形出能摧毁王冠的锈色匕首，“妈妈帮你摘下这顶王冠。”
地核的基因归零场突然逆转，终焉齿轮在锈色之箭的冲击下显形出裂缝，显形出其后的基因图书馆 —— 里面封存着所有文明未被选择的进化可能。美羽的噬神者终章形态踏碎齿轮，显形出图书馆中央，沉睡着的竟是她在七千九百次实验中，每次选择不完美时诞生的、真正的自我 —— 那是个带着齿轮缺口的、能自由进化的基因体。
“现在，” 美羽的声音在基因图书馆回荡，她的噬神基因显形出能包容所有可能的存在之网，“该让每个生命，自己定义进化的方向了。”
话未说完，基因重启键突然爆发出强光，显形出键面深处，初代园艺师们的集体意识正操控着完美病毒，目标直指美羽的共生之痕。而在时间基因隧道的尽头，小柯发现的错误密钥突然崩解，显形出其后的、能让一切回归原点的 “基因终焉”—— 那是个由七千九百个齿轮组成的、能绞碎所有不完美基因的陷阱。